牛皮纸档案盒的尺寸规格设计，充分考虑了档案文件的实际情况和存储需求。常见的外形尺寸为长 310mm、宽 220mm，这一尺寸能较好地适配国际通用 A4 型（297mm×210mm）文件，方便文件的装入与取出。厚度方面，一般有 20mm、30mm、40mm、50mm 等多种选择，使用者可根据文件数量和厚度灵活挑选。比如，存放少量文件的档案盒，可选择 20mm 或 30mm 厚度；若文件较多较厚，则可选用 40mm 或 50mm 厚度。
对于一些特殊档案，如大幅图纸、成册书籍等，市场上也有定制尺寸的牛皮纸档案盒。定制时，需准确测量档案的长、宽、高尺寸，确保档案盒能紧密贴合档案，既不会因过大导致文件晃动，也不会因过小而无法容纳。在档案盒的脊背设计上，也有不同宽度，从 2cm 到 6cm 不等，脊背宽度的选择同样取决于档案的厚度和存储方式，较宽的脊背可容纳更多文件，且便于在脊背上标注档案名称和编号，方便档案上架后的查找。